Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ms4a4dQ99N05 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ms4a4dQ99N05 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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