Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rwdd2bQ99M03 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rwdd2bQ99M03 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rwdd2bQ99M03 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rwdd2bQ99M03 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms