Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp11Q99K46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp11Q99K46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp11Q99K46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp11Q99K46 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp11Q99K46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp11Q99K46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms