Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufsp2Q99K23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufsp2Q99K23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufsp2Q99K23 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ufsp2Q99K23 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufsp2Q99K23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufsp2Q99K23 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ufsp2Q99K23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms