Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl22Q99JN2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl22Q99JN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhl22Q99JN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl22Q99JN2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl22Q99JN2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms