Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn16Q925N4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn16Q925N4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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