Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Med1Q925J9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Med1Q925J9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Med1Q925J9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Med1Q925J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Med1Q925J9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Med1Q925J9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Med1Q925J9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Med1Q925J9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms