Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf144aQ925F3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf144aQ925F3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf144aQ925F3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf144aQ925F3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf144aQ925F3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 649.9 ms