Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim66Q924W6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim66Q924W6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim66Q924W6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim66Q924W6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim66Q924W6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms