Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EedQ921E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EedQ921E6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EedQ921E6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EedQ921E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EedQ921E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EedQ921E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EedQ921E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EedQ921E6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EedQ921E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EedQ921E6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EedQ921E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EedQ921E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EedQ921E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EedQ921E6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EedQ921E6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EedQ921E6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EedQ921E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EedQ921E6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EedQ921E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms