Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE5

Pcdhb10, Protocadherin beta 10, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb10Q91VE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhb10Q91VE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhb10Q91VE5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhb10Q91VE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhb10Q91VE5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhb10Q91VE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhb10Q91VE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms