Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx7Q8VDS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cbx7Q8VDS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx7Q8VDS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx7Q8VDS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx7Q8VDS3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms