Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Stx19Q8R1Q0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx19Q8R1Q0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx19Q8R1Q0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx19Q8R1Q0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx19Q8R1Q0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms