Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PolbQ8K409 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PolbQ8K409 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolbQ8K409 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolbQ8K409 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolbQ8K409 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolbQ8K409 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms