Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FntbQ8K2I1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FntbQ8K2I1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FntbQ8K2I1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FntbQ8K2I1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FntbQ8K2I1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FntbQ8K2I1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FntbQ8K2I1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FntbQ8K2I1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FntbQ8K2I1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FntbQ8K2I1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FntbQ8K2I1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms