Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Neil3Q8K203 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Neil3Q8K203 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Neil3Q8K203 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neil3Q8K203 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neil3Q8K203 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms