Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c1Q8K193 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn34c1Q8K193 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn34c1Q8K193 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c1Q8K193 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms