Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip10Q8CJ53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip10Q8CJ53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip10Q8CJ53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trip10Q8CJ53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip10Q8CJ53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms