Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clip4Q8CI96 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clip4Q8CI96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clip4Q8CI96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clip4Q8CI96 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip4Q8CI96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms