Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rp1l1Q8CGM2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rp1l1Q8CGM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rp1l1Q8CGM2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rp1l1Q8CGM2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Rp1l1Q8CGM2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Rp1l1Q8CGM2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Rp1l1Q8CGM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms