Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brf1Q8CFK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brf1Q8CFK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brf1Q8CFK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brf1Q8CFK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Brf1Q8CFK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brf1Q8CFK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brf1Q8CFK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms