Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc28bQ8CEG5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc28bQ8CEG5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms