Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms