Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd4aQ8CBY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd4aQ8CBY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd4aQ8CBY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd4aQ8CBY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd4aQ8CBY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd4aQ8CBY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms