Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn7l2Q8C8K6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn7l2Q8C8K6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn7l2Q8C8K6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn7l2Q8C8K6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms