Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E0

Cfap36, Cilia- and flagella-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap36Q8C6E0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap36Q8C6E0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap36Q8C6E0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap36Q8C6E0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap36Q8C6E0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap36Q8C6E0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap36Q8C6E0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms