Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf428Q8C1M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
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Znf428Q8C1M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf428Q8C1M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf428Q8C1M2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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Znf428Q8C1M2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Znf428Q8C1M2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf428Q8C1M2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf428Q8C1M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf428Q8C1M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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Znf428Q8C1M2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Znf428Q8C1M2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf428Q8C1M2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf428Q8C1M2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
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Znf428Q8C1M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf428Q8C1M2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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Znf428Q8C1M2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf428Q8C1M2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf428Q8C1M2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
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