Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y0

Ppp4r4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r4Q8C0Y0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp4r4Q8C0Y0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp4r4Q8C0Y0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp4r4Q8C0Y0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r4Q8C0Y0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r4Q8C0Y0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r4Q8C0Y0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms