Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trub1Q8C0D0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trub1Q8C0D0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trub1Q8C0D0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub1Q8C0D0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trub1Q8C0D0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trub1Q8C0D0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms