Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Als2cr12Q8BVM7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Als2cr12Q8BVM7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Als2cr12Q8BVM7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Als2cr12Q8BVM7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms