Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx17Q8BVL3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx17Q8BVL3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx17Q8BVL3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx17Q8BVL3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx17Q8BVL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx17Q8BVL3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx17Q8BVL3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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