Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS45

Ttc26, Intraflagellar transport protein 56, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc26Q8BS45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc26Q8BS45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc26Q8BS45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc26Q8BS45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc26Q8BS45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ttc26Q8BS45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc26Q8BS45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc26Q8BS45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms