Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK5

Ccdc184, Coiled-coil domain-containing protein 184, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc184Q8BMK5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc184Q8BMK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc184Q8BMK5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms