Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK5

Ccdc184, Coiled-coil domain-containing protein 184, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc184Q8BMK5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc184Q8BMK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc184Q8BMK5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc184Q8BMK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc184Q8BMK5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc184Q8BMK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc184Q8BMK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc184Q8BMK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc184Q8BMK5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms