Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcfc2Q8BKT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcfc2Q8BKT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcfc2Q8BKT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcfc2Q8BKT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms