Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI99

Znf879, Zinc finger protein 879, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf879Q8BI99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf879Q8BI99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf879Q8BI99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf879Q8BI99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf879Q8BI99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf879Q8BI99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms