Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Htatsf1Q8BGC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Htatsf1Q8BGC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Htatsf1Q8BGC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms