Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Alkbh8Q80Y20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Alkbh8Q80Y20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh8Q80Y20 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh8Q80Y20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh8Q80Y20 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms