Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rims3Q80U57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rims3Q80U57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rims3Q80U57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims3Q80U57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rims3Q80U57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms