Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700010I14RikQ7TPG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700010I14RikQ7TPG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700010I14RikQ7TPG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
1700010I14RikQ7TPG0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms