Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,31■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
ScocQ78YZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,26■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
ScocQ78YZ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,17■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
ScocQ78YZ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
ScocQ78YZ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,08■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
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