Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc25Q78PG9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc25Q78PG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc25Q78PG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc25Q78PG9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms