Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M2Q6W9L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M2Q6W9L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-M2Q6W9L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M2Q6W9L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M2Q6W9L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms