Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kcnip4Q6PHZ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnip4Q6PHZ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms