Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx13Q6PHS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx13Q6PHS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx13Q6PHS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx13Q6PHS6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms