Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atl2Q6PA06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atl2Q6PA06 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atl2Q6PA06 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atl2Q6PA06 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl2Q6PA06 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms