Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6aQ6IE21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6aQ6IE21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud6aQ6IE21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otud6aQ6IE21 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6aQ6IE21 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms