Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4fQ66X05 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrp4fQ66X05 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrp4fQ66X05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4fQ66X05 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4fQ66X05 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4fQ66X05 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms