Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC080695Q66JY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC080695Q66JY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC080695Q66JY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC080695Q66JY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC080695Q66JY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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