Protein–RNA interactions for Protein: Q64314

Cd34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd34Q64314 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd34Q64314 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd34Q64314 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd34Q64314 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd34Q64314 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd34Q64314 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd34Q64314 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms