Protein–RNA interactions for Protein: Q641P0

Actr3b, Actin-related protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr3bQ641P0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actr3bQ641P0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actr3bQ641P0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actr3bQ641P0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actr3bQ641P0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actr3bQ641P0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actr3bQ641P0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms